Набор используется для качественного определения in vitro генов ORF1ab/N/S нового коронавируса 2019-nCoV в образцах из дыхательных путей, включая мазки из ротоглотки, мазок из носоглотки, мокроты, и одновременного типирования мутаций HV69-70 del.Как сообщается в базе данных GISAID, более 95% зарегистрированных вариантов последовательностей Omicron включают делецию в HV69-70, которая может вызвать отказ гена-мишени S (SGTF) в анализах ПЦР.SGTF можно использовать в качестве прокси-маркера для скрининга Omicron.
Наборы праймеров и зонд, меченый FAM, предназначены для специфического обнаружения лабораторного гена ORF 2019-nCoV, зонда, меченного VIC, для гена N 2019-nCoV, зонда, меченного ROX, для мутации S гена HV69-70 del 2019-nCoV.Ген РНКазы P человека, экстрагированный одновременно с тестируемым образцом, обеспечивает внутренний контроль для проверки процедуры выделения нуклеиновых кислот и целостности реагента.Зонд, нацеленный на ген РНКазы P человека, помечен CY5.
Система ПЦР в реальном времени: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex. Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;